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La vallée du Rhône en PACA est un territoire marqué par une forte disparité, d’une part, entre le monde rural et industriel et, d’autre part, entre richesses naturelles et fortes pressions foncières et industrielles.

Les zones cultivées de la région se trouvent essentiellement le long du Rhône et des rivières (notamment la Durance et le Var). Les vignes et les cultures sont souvent traitées avec des produits phytosanitaires et des fertilisants qui laissent de moins en moins de place aux plantes messicoles ainsi qu’au cortège faunistique associé (entomofaune notamment).
Les eaux du Rhône souffrent d’un état chimique désastreux de part la pollution industrielle tant en amont (Rhône-Alpes) qu’en aval (industrie de Fos sur mer) : métaux lourds, PCB et autres polluants continuent à y être déversés.
Notons que les spécificités du climat méditerranéen (forte température) et la pression humaine constituent des facteurs aggravants.

Malgré ces fortes pressions, la vallée du Rhône abrite des espaces naturels très spécifiques tels que le mont Ventoux, les Baronnies et la Camargue au niveau de son delta. Ces espaces sont riches en biodiversité en accueillant des espèces endémiques tel que le Apron ou encore de nombreux oiseaux migrateurs présents essentiellement dans le delta du Rhône.
Enfin, la vallée du Rhône est un territoire très concerné par le risque inondation. En effet, l’ouest du département des Bouches du Rhône et une partie du Vaucluse subissent régulièrement des inondations, accentuées par l’imperméabilisation des surfaces due la pression foncière.